人類初の大規模な宇宙への移住計画のため、滅びゆく地球を旅立った宇宙船コヴェナント号は、コールドスリープ中の2000人の入植者を乗せ、移住先の惑星オリガエ-６を目指していた。

その航行の途中、大事故に見舞われたコヴェナント号は女性の歌声が混じった謎の電波をキャッチし、発信元である別の惑星へ向かう。

その神秘的な惑星は、女性乗組員ダニエルズ（ウォーターストン）にとっても人類の新たな希望の地に思えた。はたしてダニエルズの前に現れた完全な知能を持つアンドロイド（ファスベンダー）は敵か、それとも味方か。そしてエイリアン誕生をめぐる驚愕の真実とは何なのか。

コヴェナント号にもエイリアンの脅威が迫るなか、ダニエルズはその哀しみを乗り越え、あまりにも過酷な運命に立ち向かっていくのだった……。

・デヴィッド/ウォルター：マイケル・ファスベンダー

・ダニエルズ：キャサリン・ウォーターストン

・オラム：ビリー・クラダップ

・テネシー：ダニー・マクブライド

・ロープ：デミアン・ビチル

・カリーヌ：カルメン・イジョゴ

・ファリス：エイミー・サイメッツ

・リックス：ジャシー・スモレット